El término municipal de Fuente Tójar es pequeño, apenas abarca 24 kilometros cuadrados de los que un 92,25% corresponde a cultivos, en su mayoría, del olivar. El resto, el 7,75% son “zonas naturales”: afloramientos de rocas, linderos, las laderas. Aquí crece una rica variedad de plantas autóctonas de gran valor, no sólo natural sino cultural, por las gentes desde antaño.
Las comunidades vegetales no son conjuntos biológicos estáticos, sino que cambian con el tiempo, Los cambios son más o menos rápidos e intensos.
En cuanto a la vegetación de la ribera podemos encontrarnos con las siguientes especies:
Alamo blanco y Alamo negro
Tajares y Tamaris canariensis
Sauces
Adelfa
Mandragoras
Juncos, Eneas, Cañas, etc
En cuanto a la vegetación no ligada al curso del agua podemos encontrar:
Encinas
Olivos
Lentisco
Cornicabra
Majuelo
Alcaparra
Zumaque
Retamas
Esparto
Aulagas y tojo
Hinojo y gran diversidad de herbáceas, etc.
En las vegas será posible encontrar huertas.